Popura Taneshima es una niña de secundaria de tamaño reducido que trabaja en un restaurante familiar llamado Wagnaria y el gerente le dice que busque un nuevo empleado. Después de preguntar a extraños y amigos, encuentra a un niño de su escuela llamado Sōta Takanashi que acepta trabajar en el restaurante. Sōta se adapta rápidamente a trabajar en Wagnaria cuando conoce a los otros empleados y descubre sus diversas peculiaridades. Sōta se pone del lado malo del gerente, Kyōko Shirafuji, después de un comentario sobre su edad, lo que la llevó a trabajar demasiado durante varias semanas. Un día, Sōta se encuentra en el mismo turno con Mahiru Inami, una chica a la que aún no había conocido, que sufre de androfobia y golpea a Sōta en la cara al conocerlo por primera vez.